《萌宝战警》讲述了豆丁、可乐、可诺、石头四位天性正义善良的小朋友借助机甲武装的神奇力量，组成战队，在重重困难面前，众人齐心协力，善用科学，勇往直前，不畏艰险，用勇气与智慧战胜邪恶势力科学怪咖“铁算盘”，保卫家园小石城并寻找神秘失踪的豆瓣博士。
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故事发生在热闹的蓝鲸市，桂宝（王云飞 配音）是一个半吊子科学家，成天发明的尽是一些稀奇古怪的玩意儿，惹出了不少的麻烦，也闹了许多笑话。因此，忍无可忍的市长颁布了禁令，禁止桂宝再搞发明。
天蓬元帅朱小八厌倦天天吃仙丹，向往人间美食，因贪吃搞砸了王母娘娘的蟠桃宴，和天狗降落人间福星镇，由此开启一段欢乐冒险旅程。
芭比（凯莉·谢里丹 Kelly Sheridan 配音）、思佩（Kazumi Evans 配音）、思倩（Claire Corlett 配音）和凯丽是情同手足的四姐妹，虽然她们有着迥异的性格，但是彼此之间的感情十分要好。芭比和妹妹们一起回到故乡探望奶奶，没想到竟然在阁楼上发现了一张布满了灰尘了藏宝图，根据藏宝图显示，一份失落已久且价值连城的宝藏就隐藏在她们所在的小镇里。
